「思い出して、翅（はね）があったころのことを」 1萬(wàn)2千年前の想いに応え 、繋がったのは欠けたこころ。 太陽(yáng)と月と火星が出會(huì)うとき、新たな合體の調(diào)べが流れる──！ 湘南の海に浮かぶ小島、江の島。 美しくのどかなその浜辺に
、〈私立江ノ島學(xué)園〉はある。 學(xué)園には、全國(guó)から優(yōu)秀な子どもが集められ
、 最新の機(jī)器を使った英才教育が施されていた。 特殊強(qiáng)化クラスの生徒〈エレメント〉に選ばれたサッコ、リミヤ、トシは、 感情の力で動(dòng)く戦闘機(jī)〈ベクターマシン〉の操縦を命じられ、 謎の侵略兵器〈神話獣〉との戦いを余儀なくされる
。 戦いのさなか
、不可思議なヴィジョンに導(dǎo)かれ
、サッコは叫ぶ──。 「想星合體
！ GO
、アクエリオン ！」 繰り返される輪廻の果てに 、現(xiàn)れた機(jī)械天翅アクエリオン。 宿命を背負(fù)った少年少女は、 得體のしれない団體〈宇宙たまごの會(huì)〉や大人たちの思惑が交錯(cuò)する中、 この宇宙の真実と向き合っていくことになる……。 これは、おのれの感情と宇宙の存亡を賭けて紡がれる、壯大な愛(ài)の神話。